Het verhaal begint met een confrontatie tussen twee rivaliserende helden, ZET en ALPHAS, en gaat vervolgens terug naar hun oorsprong - Jin Kanzaki, een jonge man met het vermogen om te transformeren in een bovenmenselijk wezen dat bekend staat als ZET, en Kouga Amagi, een jonge man met een sterk rechtvaardigheidsgevoel die technologie gebruikt om te vechten als ALPHAS.
