Em uma outra galáxia, um enorme cometa branco viajava a uma grande velocidade, destruindo tudo em seu caminho e conquistando vários planetas: o Cometa Império, uma gigantesca cidade-fortaleza que possuía o maior e mais poderoso exército do universo. Seu próximo objetivo: conquistar a Via Láctea, mais especificamente, a Terra. Assim, sob o comando de seu líder, o Imperador Zordar, o Cometa Império, junto com suas tropas, segue rumo à Terra, visando a sua dominação. Então, com o intuito de investigar o que estaria acontecendo nos arredores da galáxia, o Yamato parte novamente para o espaço, em direção a Telezart. Porém, este era justamente o plano do inimigo. Uma nova e terrível batalha estava prestes a começar.
